В 1956 - Вилен Аствацатрян окончил [[Ереванский государственный медицинский институтуниверситет им. Мхитара Гераци|Ереванский медицинский институт]] и стал работать в детской городской больнице.
В 1958 - поступил в аспирантуру 2-го Московского медицинского института имени Пирогова, по окончании которой был ассистентом кафедры педиатрии факультета усовершенствования врачей Ереванского медицинского института.