В 2007 году Афеян и изобретатель Дэвид Берри основали компанию Joule Unlimited, которая занимается солнечной энергетикой. В 2010 и 2011 годах Joule Unlimited была названа журналом Technology Review одной из 50 наиболее инновационных компаний.
В 1999 году основал компанию Flagship Ventures, которая занимается венчурными капиталовложениями и предпринимательскими проектами и владеет инвестиционным портфелем в размере 1 миллиард долларов.
Кроме того, он является старшим преподавателем Массачусетского технологического института (МТИ) в Школе менеджмента Слоуна и на факультете биотехники, где более 5 лет читает курс лекций на тему «Создание новых предприятий». Он также ведущий преподаватель на факультете биоинженерии, автор многочисленных научных публикаций. Др. Афеян получил степень бакалавра в области химической инженерии в Университете МакГилл в Монреале.