Теолог, филолог и педагог, архиепископ Мкртич Агавнуни родился в 1863г. в турецком городе Партизаке.
Учился в местной национальной [[Национальный Институт Здравоохранения им. академика С.Х. Авдалбекяна|школе Нерсесян]], затем был помощником учителя религии и турецкого языка, учителем дьяконства в Атабазаре и Никомедии.
В 1890г. в [[церкви Сурб Аствацацин Никомедии]] епископом [[Степаносом Овакимяном]] рукоположен в архимандриты.