С 1919 жил в Ереване и участвовал в основании медицинского факультета в [[Ереванский государственный университет|Ереванском государственном университете]].
А. А. Акопян принимал активное учасгае участие в создании медицинского факультета ЕГУ. Создал кафедру физиологии и руководил ею до 1936 г.
В 1924 г. организовал отделение нервных болезней, на базе которого в дальнейшем была создана невропатологическая клиника.