В марте 1919 года кондаком Католикоса Геворга У последовал ряд важных назначений по Нахичевано-Бессарбской епархии. Архимандрит о.Муше был назначен временным управляющим нахичевано-бессарбской епархии, а на его место – нахичеванского викария и настоятеля Крестовоздвиженского монастыря – архимандрит [[Зограбян Усик|Усик Зорабьян]].
23 марта 1919 г. в день праздника [[Григорий Просветитель|Св. Григория Просветителя]] о.Муше отслужил литургию в соборе и прочитал кондак Католикоса о положении армянского народа и о текущем моменте.
Несмотря на то, что ходатайство нахичеванского общества и лично о.Муше об учрежеднии в Нахичеванин духовной консистории вновь было отклонено Эчмиадзинским Синодом, о.Муше сумел добиться этого посредством обращения к заведующему отделом исповеданий при Главнокомандующем Добровольческой армией.