В 1990 - 1991 годах работал заместителем торгпреда СССР в Иракской Республике, руководил эвакуацией из этой страны советских специалистов, а также специалистов, работающих в Кувейте, во время ирако-кувейтского конфликта и операции США "Буря в пустыне".
В 1991 - 1995 годах он работал советником начальника ГИУ, заместителем директора Центра по координации и контролю ВО "Оборноэкспорт".
В 1995 году Виллен Нерсесович в чине полковника ушел на заслуженный отдых по состоянию здоровья.