Строительство церкви было завершено в 1807 году. Свой завершенный вид Собор приобрел в 1814 г. Одновременно со строительством западного северного и восточного входов были построены шесть магазинов, которые стали собственностью церкви. По указанию Иосифа Аргутинского их доходы должны были быть переданы для основания городской гимназии. Однако, после его смерти, в 1814 г.надеждам на быстрое основание гимназии не суждено было сбыться, так как без ведома владыки - архиепископа [[Ованеса Гарнакерьяна|Ованеса Гарнакерьяна]] - магазины были проданы.
В 1848 году вокруг церкви, по предложению архиепископа Матевоса (Новонахичеванский епархиальный начальник) была построена ограда вокруг церкви.
В 1852 году сильный ураган снёс позолоченный крест вместе с постаментом колокольни. Церковь нуждалась в ремонте.
В 1942 году церковь была передана армянской общине. Благодаря пожертвованиям была собранна необходимая сумма для проведения капитального ремонта здания и частичного восстановления интерьера.
27 декабря 1943 года церковь была вновь освящена.
=Архитектура=
Это было величественное монументальное культовое здание, наиболее последовательно из всех нахичеванских храмов воплотившее в своем облике приемы и формы русского классицизма. В плане храм представлял собой прямоугольник со вписанным крестом, выступающий на восток полуциркульной апсидой, пристроенной с запада трехъярусной колокольней. Средокрестие храма завершалось массивным круглым барабаном, увенчанным куполом с фонарем.