Г. Г. Агабальянц — автор более 60 научных трудов и 12 изобретений.
В соавторстве с А. М. Фроловым-Багреевым им был написан основной труд "Химия вина". Известный кубанский ученый возглавлял комиссию Международной организации по виноградарству и виноделию. Под его руководством была создана лаборатория игристых вин на базе Всесоюзного института пищевой промышленности. С 1961 года Агабальянц работал в Москве, был членом совета Министерства пищевой промышленности СССР, членом экспертной комиссии ВАК. *Химия вина. — Москва, 1951 (соавт.)*Химико-технологический контроль производства Советского шампанского. — Москва, 1954*Химико-технологический контроль виноделия. — Москва, 1969 (соавт.).