Согласно некоторым источникам, в 1092 г. Крест Варага из [[Монастырь Варагаванк (Ван, Западная Армения, Турция)|монастыря Варагаванк ]] был перенесен в церковь Сурб Аракелоц.
В 1956 г. церковь была превращена в мечеть, а до этого использовалась как тюрьма.