17 июля 2004 года, указом президента РА, назначен заместителем генерального прокурора РА. Согласно приказу Генерального прокурора, Саркисян М. координирует работы управления по преступлениям против экономической деятельности и имущества, управления по делам расследуемым в органах национальной безопасности, управления по делам против личности и данных сфер, организует и руководит работами комиссии по этике при Генеральном прокуроре РА, вопросы гражданской защиты.