Выросший без отца, в 1937 году Мхитар Багдасарян с отличием окончил школу и в том же году поступил на исторический факультет [[Ереванского Государственного Университета]].
В 1941 году Мхитара Багдасаряна призвали в армию. В 1941--1942 гг. он служил в Армянском Республиканском военкомате; в конце 1942 года его послали на учебу в Орджоникидзевское Пехотное пехотное Краснознаменное училище. Когда фашисты подошли к станции Бслан, весь состав училища участвовал в боях, и под Моздоком был ранен. После лечения в госпитале Мхитар Багдасарян вернулся в Тбилиси, где жили его родные с 1938 года.
В конце 1943 года начинается педагогическая деятельность Багдасаряна М. О. в качестве директора средней школы в селе Дамия Марнеульского района Грузии, после в 1951 г. переводят директором Ходжорнинской средней школы. С 1943 года по 1961 год он по совместительству работал школьным инспектором в Марнеульском РОНО.