Окончив в 1949 году в числе первых выпускников [[Ереванский государственный институт театра и кино|Ереванский театральный институт]], Бабкен Арутюнян поступает в аспирантуру Сектора истории и теории искусств [[Национальная академия наук Республики Армения|АН АрмССР]] и направляется на учебу в Москву, в Институт истории искусств АН СССР.
Здесь в 1953 году под руководством выдающегося театроведа [[Гоян Георг Иосифович|Г. И. Гояна]] он защищает кандидатскую диссертацию «Русская советская драматургия на армянской сцене», после чего становится младшим научным сотрудником Сектора истории и теории искусств АН АрмССР. Вскоре выходит его первая монография «Армяно-русские театральные связи», одновременно на армянском и русском языках.