1815-1821 - первый ректор в Московском [[Лазаревский институт восточных языков|Лазаревском институте восточных языков]], там же преподавал закон Божий и армянскую словесность. Его передовые взгляды на воспитание привели к конфликту с [[Салатян Микаел|Микаэлом Салатяном]], церковником-мхитаристом. Аламдарян ушёл из института.
1824-1830 - работал в [[Нерсесяновское училище|училище Нерсисян]] в Тифлисе: был ректором, преподавателем и управляющим типографией, где под его руководством издано около 30 учебных книг.<ref><small>Этот период истории семинарии наиболее яркий, давший ряд крупных армянских общественных деятелей. В истории школы эти годы известны как «Век Аламдаряна».</small></ref>
Овдовев, принял монашество в Эчмиадзине, был викарием Закавказской армянской епархии.
Вардапет Арутюн Аламдарян обвинялся как единомышленник [[Нерсес V Аштаракеци|Нерсеса Аштаракеци]]. По указу И. Паскевича, Синод Эчмиадзина в 1830 г. отправил его в ссылку в Ахпат. Спустя год, в 1831 г. , он был назначен настоятелем Новонахичеванского монастыря Сурб Хач
С 1833-1834 – настоятель [[монастырь Сурб-Хач|монастыря Сурб-Хач в Нор-Нахичевани]], работал в монастырской школе.