*Обнаружил явление перемещения растительных сообществ под влиянием роста гор и обосновал так называемую «Теорию тектонической динамики горных биотопов Агаханянца»
*Провёл исследования по измерению и динамике внутрисосудистого давления жидкостей в корневой и стволовой частях растений Памира.
собрал *Собрал обширную коллекцию гербариев флоры горных и полупустынных областей Центральной Азии и Кавказа.
===Геоботаника===
*Выявил генезис и дал описание биотопа Усойского завала на реке Мургаб