С годами стал больше заниматься литографией, исполнял литографии с портретов своего брата Акоба Овнатаняна. В 1859 г. в Петербургской типографии Д. Кесневиля увидела свет книга «Воспоминания о Пажеском его Императорского Величества корпусе. Издал и рисовал художник, титулярный советник и кавалер А.Н. Авнатамов» с 11 цветными иллюстрациями 60 х 44 см, сделанными на основе рисунков с натуры И. Шарлемана. Оригиналы литографий хранятся в Государственном Пушкинском музее в Москве.
На протяжении шестнадцати лет Овнатанян ктитор церкви являлся управляющим армянских церквей Санкт-Петербурга и в 1887 г. за безупречную работу церковный совет назначил ему персональную пенсию.
==Произведения==
*литографии с портретов брата Акопа, литографии с изображениями скаковых лошадей.
*Появление гравюр Агатона Овнатаняна и [[Катаньянц Иван|Ованеса Катаньянца]] положило начало развитию армянской станковой графики.
*Похоронен на Смоленском армянском кладбище в Санкт-Петербурге. Захоронение утрачено в годы советской власти.
=Библиография=
*Братья Акоп и Агафон Овнатаняны. Каталог выставки, М., 1952